登記申請と同時に、登録免許税を納める必要があります。
ご自身で登記申請をされるなら、印紙で納付されるのが便利だと思います。
現金納付もありますが、納付書に現金を添えて日本銀行又は代理店、税務署に納付書を提出して、領収書をもらいます。
この領収書を登記申請書に貼付しますが、少し手間です。
それよりも、登記申請する法務局で印紙を買って、その印紙を登記申請書に添付するほうが、楽だと思います。
もうひとつ、オンラインで申請する場合は、インターネットバンキングで納付することができます。
しかし、司法書士でない限り、オンライン申請する環境は、まず整っていないでしょうから、あまり考える必要はないと思います。